L'Hospital Clínic de Barcelona es regula pel decret del 10 d'octubre de 1952, amb ajustaments posteriors en alguns aspectes, que estableix una Junta de Patronat com a màxim òrgan de govern de l'hospital.
El Director General, nomenat per la Junta de Patronat, és el darrer responsable de la gestió de l'hospital Clínic i compta amb una estructura directiva de primer nivell constituïda pel Gerent i el Director Mèdic que actuen com a coordinadors de les Direccions Funcionals:
-
Enginyeria i Serveis Generals, Logística, Serveis Econòmics i Recursos Humans en el cas del Gerent;
-
Infermeria, Docència i Investigació en el cas del Director Mèdic.