L’Hospital Clínic de Barcelona ha centrat el seu desenvolupament actual en un model assistencial basat en l’organització enfocada al pacient en forma d’Instituts i Centres. D’aquesta manera realitza una assistència el més personalitzada possible, avança cap a una gestió descentralitzada i implanta progressivament el model de gestió clínica o managed care, amb responsabilitat creixent dels professionals sanitaris en la gestió de recursos.

Els 11 instituts i centres, organitzats per especialitats que el composen, són: